Doğu Türkistan bayrağı, Türkiye'de yasal olarak yasak değildir. Bayrağın kullanımı, toplanma ve ifade özgürlüğü kapsamında değerlendirilir. Ancak, bayrağın provokatif veya yasa dışı amaçlarla kullanılması durumunda yetkililer tarafından müdahale edilebilir. Bu durum, genel olarak ifade özgürlüğü ve toplanma özgürlüğü gibi temel hakların sınırlandırılması çerçevesinde değerlendirilmelidir.